Het wordt gezien als een good practice om de elementen te scheiden van de diagrammen in een omvangrijke enterprise architectuur. Het is mogelijk om de objecte te scheiden in de verschillende subpackages van de enterprise architectuur. Hier is ervoor gekozen dit te doen in de root package van de enterprise architectuur.
In dit voorbeeld is een indeling gemaakt voor subpackages per ArchiMate laag en of elementtype. Hierbij zijn er verschillende andere indelingen mogelijk. Bepaal hier de indeling die in de context van de eigen organisatie goed werkt. Ook het sorteren van de elementen op elementtype in een allesomvattende collectie werkt bij sommige organisaties goed.